A protein's secondary structure consists of regular, repeated patterns in different regions of a polypeptide chain. Cấu trúc bậc hai của protein được tạo nên từ những kiểu lặp lại ở các đoạn khác nhau của chuỗi polypeptide.
The tertiary structure will have a single polypeptide chain "backbone" with one or more protein secondary structures, the protein domains. Cấu trúc bậc ba sẽ có một chuỗi 'xương sống' polypeptide duy nhất với một hoặc nhiều cấu trúc bậc hai của protein, và các miền protein.